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Il Wolfram Notebook Indexer (Indicizzatore di Notebook) è stato incluso in Mathematica 5.2.

Dopo aver installato l'appropriato plug-in per Google Desktop Search, Apple Spotlight, o Windows Desktop Search, l'Indexer esamina le espressioni nei notebook in maniera tale che possono essere ricercate le espressioni di Mathematica, il linguaggio di controllo, qualsiasi carattere Unicode compreso il Japanese, Chinese, ed altri caratteri a 16-bit.

L'Indexer supporta alcune caratteristiche aggiuntive per alcuni motori di ricerca, ad esempio gli identificatori di categorie speciali in Spotlight.